E5系

改札口

• 2面3線（うち1線は下り通過線）の地上駅（橋上駅）であり、駅本屋棟の外側に海峡線運行列車が通過する狭軌の待避線（上下各2線）、また下り狭軌待避線と津軽線の間には奥津軽保守基地（標準軌・狭軌）が設けられている。新幹線のホームは有効長が263メートルで、可動式ホームドアが設置されている。
• 駅舎は鉄骨造り3階建て。デザインコンセプトは「本州最北の地から北の大地へ 〜津軽海峡の四季が感じられる駅〜」。高台に設置されている駅本屋棟と高さ約25メートルの昇降棟があり、両者は下り狭軌線、保線用線路及び津軽線を跨ぐ通路がつないでいる。昇降棟の壁面はガラス張りで、青函トンネルをゲート風にデザインして大きな弧を描いている。
• 直営駅である。みどりの窓口、指定席券売機、話せる券売機、新幹線自動改札機が設置されている。駅出入口は1か所で、反対側（駅東側）へは直接出られない。構内には売店などの設備はない。
  駅レンタカー業務については「道の駅いまべつ」が受託で行っている。

• 上下方向別の単式ホーム2面2線を有する無人駅であった。駅の設備は簡素で跨線橋がなく、下りホームへの移動は構内踏切を利用していた。
• 開業当初は相対式ホーム2面2線であったが、北海道新幹線の建設工事に伴い、2013年（平成25年）に旧ホームの外側にのちに奥津軽いまべつ駅狭軌待避線の一部となる在来線用の線路と仮設ホームが設置され、同年10月に仮設ホームの使用を開始し（上り線は18日、下り線は25日）、旧ホームは撤去された。その後、旧ホームのあった位置には新幹線ホームが建設され、在来線は本線から分岐して新幹線ホームを抱き込み、仮設ホームはさらにその外側に設置されていた
• なお、上りホームへ行くためには引き続き函館方の構内踏切を渡る必要があったので、将来新幹線の本線となるレールを一般の旅客に歩いて渡らせるという珍しい状態が続いた。また、踏切からは建設中の新幹線ホームを間近に見ることができた。
• 駅に向かう通路（階段）には屋根が設置されていたが、ホームには屋根がなかった。2014年（平成26年）12月1日から2015年（平成27年）8月9日まで、北海道新幹線の試験走行に伴い、上り特急「白鳥96号」発車後から翌朝の下り特急「白鳥93号」発車前まで、安全上の観点から海峡線ホームは立ち入り禁止となっていた。
• 列車の停車が無くなった2015年（平成27年）8月10日以降、ホームに立ち入るための通路が閉鎖され、同月中に仮設ホームも撤去された。

• 2002年（平成14年）12月1日のダイヤ改正で快速「海峡」が廃止されてから北海道新幹線が開通する2016年（平成28年）3月25日（事実上21日）まで、津軽今別駅を含む海峡線の蟹田駅 - 木古内駅間は特急列車のみの運転となり、普通（快速）列車が設定されていなかった。
• そのため、上記区間に含まれる各駅相互間で特急列車の普通車自由席に乗車する場合には、特急料金が不要となる特例が設けられ、青春18きっぷや北海道&東日本パスといった普通列車専用の特別企画乗車券でも適用されていた。

• 北海道新幹線開業後は青函トンネルを通る定期旅客列車は全て新幹線列車かつ全席指定となり、この特例も廃止されたが、代わって青春18きっぷについては「青春18きっぷ 北海道新幹線オプション券」（2,490円）を購入する場合のみ、津軽線津軽二股駅乗り換え⇔奥津軽いまべつ駅[注釈 7] - （北海道新幹線）木古内駅 - （道南いさりび鉄道線）五稜郭駅⇔函館本線乗り換え間を本きっぷ1枚で1回乗車できる特例が新たに設けられた。
• また、秋の乗り放題パスでも同様に「秋の乗り放題パス 北海道新幹線オプション券」（大人2,490円、小人1,240円）が発売される。また、『北海道&東日本パス』については、別途特定特急券を購入すれば、当駅を含む「新青森 - 新函館北斗」相互間で、普通車指定席の空席を利用できる特例が設けられた。

• 旧・津軽今別駅時代から津軽線津軽二股駅と隣接しているが別駅扱いであり、両駅を乗換駅として、運賃を通算した1枚の乗車券を発行することはできない。
• また、北海道新幹線と並行する津軽線は幹在同一路線となっていないため、営業キロ601km以上で割引となる往復乗車券は、どちらかに発駅または着駅の指定をしないと適用にならない。
• 連絡駅としても公式には扱われていなかったが、前述の青春18きっぷ北海道新幹線オプション券では、「新幹線奥津軽いまべつ駅との乗換駅は津軽線津軽二股駅です。」の条項が案内券片に明記された。

• 今別町では2016年（平成28年）4月、新幹線で青森市方面に通学する児童・生徒の定期券料金の3分の1助成を開始し、2020年（令和2年）4月からは、高校生や大学生、通勤に利用する今別町民へ対象を拡大の上、運賃の助成額も半分へと拡充している。北海道方面へは適用対象外となっている。

歴史

• 1987年（昭和62年）10月27日：自治省（当時）が青森県や今別町などによる新駅建設費約9260万円の財政負担を承認し、新駅開業が内定。
• 1988年（昭和63年）3月13日：JR北海道海峡線（津軽海峡線）の開通に伴い、津軽今別駅（つがるいまべつえき）開業。旅客のみ取扱い。
• 当時は一部の快速「海峡」のみ停車し、特急「はつかり」は通過していた。
• 1998年（平成10年）
  • 1月31日：運輸省（当時）により北海道新幹線新青森駅 - 札幌駅間の駅・ルートが決定。同時に今別町に奥津軽駅（仮称）の設置も決定。
  • 2月3日：北海道新幹線建設主体の日本鉄道建設公団（当時）により奥津軽駅（仮称）の設置を発表。
• 2002年（平成14年）
  • この年、東北の駅百選に選定される。JR北海道の駅で東北の駅百選に選定された駅は当駅が唯一である。
  • 12月1日：快速「海峡」が廃止され、津軽海峡線の普通列車が消滅したことに伴い、「はつかり」から改称された特急「白鳥」、「スーパー白鳥」のみの停車駅となる。
• 2007年（平成19年）9月28日：北海道新幹線の奥津軽保守基地造成などの工事安全祈願祭が行われる。
• 2010年（平成22年）12月4日：特急「白鳥」のみの停車駅となる。同列車の使用車両はJR東日本所属であるため、自社車両が停車しない駅になった。
• 2011年（平成23年）11月18日：北海道新幹線奥津軽駅（仮称）路盤他工事の安全祈願挙行。
• 2012年（平成24年）
  • 4月26日：鉄道建設・運輸施設整備支援機構が青森県および今別町に対し、駅舎デザイン案を提示。
  • 5月29日：今別町が駅舎デザイン推薦案を決定し、青森県へ報告。
  • 6月8日：鉄道建設・運輸施設整備支援機構が駅舎デザインを決定。
• 2013年（平成25年）
  • 4月26日：今別町がJR北海道本社に対して、駅名を奥津軽いまべつ駅にするよう要望。
  • 6月4日：奥津軽駅（仮称）新築工事安全祈願挙行。
  • 10月18日：上り線の線路を切り替え、上り仮設ホームの使用開始。
  • 10月25日：下り線の線路を切り替え、下り仮設ホームの使用開始。
• 2014年（平成26年）
  • 3月15日：海峡線の竜飛海底駅、吉岡海底駅、知内駅の廃止により、海峡線唯一の途中駅となる。また、当駅 - 木古内駅間の駅間距離（営業キロ：74.8km）が、JR旅客6社の鉄道路線における隣接駅間の最長距離となる。さらに、青森県内に所在する唯一のJR北海道の旅客駅となる。
  • 6月11日：北海道新幹線開業後の駅名を奥津軽いまべつ駅に決定。
• 2015年（平成27年）
  • 6月30日：奥津軽いまべつ駅建築工事が竣工。
  • 7月31日：奥津軽いまべつ駅開業に向けた準備組織、「奥津軽いまべつ開業準備駅」設置。
  • 8月10日：北海道新幹線関連工事に伴い、同日から津軽今別駅が全列車通過扱いとなり旅客営業休止、同月中に仮設ホームも撤去。この時点では特急「白鳥」2往復のみの停車であったが、8名以上のグループで利用する場合、1か月前に申請すると特急を臨時停車させることができた。

• 2016年（平成28年）
  • 3月22日：津軽今別駅を含む海峡線新中小国信号場 - 木古内駅間の架線電圧を交流20,000 V・50 Hzから交流25,000 V・50 Hzに昇圧し、自動列車保安装置をATC-L型からDS-ATCに変更。
  • 3月26日：同日付で次のように改廃。
  • 海峡線津軽今別駅廃止
  • 北海道新幹線の新青森駅 - 新函館北斗駅間開業に伴い、同一地点に奥津軽いまべつ駅が開業。当駅を含む新中小国信号場 - 木古内駅間の82.1 km区間が三線軌条による新幹線（標準軌、軌間：1,435 mm）・在来線（狭軌、軌間：1,067 mm）の共用区間となる。
• 2020年（令和2年）3月14日：新幹線eチケットサービス開始。
• 2021年（令和3年）
  • 8月1日：新幹線（はやぶさ1号）の予約状況を基に竜飛岬方面へ向かう乗合タクシーを配車する実証実験を行う[14]。
  • 年度内：話せる券売機を導入。
• 2022年（令和4年）8月3日：記録的な大雨により、駅1階部分が冠水。